1.总目录；
2.申报企业承诺书；
3.《高新技术企业认定申请书》（在线打印并签名、加盖企业公章）；
4.证明企业依法成立的《营业执照》等相关注册登记证件的复印件；
5.知识产权相关材料（知识产权证书及反映技术水平的证明材料、参与制定标准情况等）、科研项目立项证明（省级（含计划单列市）以上科研项目立项证明，对已验收或结题项目需附验收或结题报告）、科技成果转化（总体情况与转化形式、应用成效的逐项说明）、研究开发组织管理（总体情况与五项指标符合情况的具体说明）等相关材料；
6.企业高新技术产品（服务）的关键技术和技术指标的具体说明，相关的生产批文、认证认可和资质证书、产品质量检验报告等材料；
7.企业职工总体情况说明与科技人员名单；
8..经具有资质并符合本《工作指引》相关条件的中介机构出具的企业近三个会计年度（实际年限不足三年的按实际经营年限，下同）研究开发费用、近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计或鉴证报告，并附研究开发活动说明材料；
9.经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告（包括会计报表、会计报表附注和财务情况说明书）；
10.近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表。
对涉密企业，须将申请认定南京高新技术企业申报材料做脱密处理，确保涉密信息安全。
